شناسایی آنالوگ های ژن های مقاومت به بیماری (rgas) در جمعیت f۱ درحال تفرق سیب زمینی با استفاده از تکنیک nbs profiling
نویسندگان
چکیده
به منظور شناسایی و جداسازی آنالوگ های ژن های مقاومت (rgas) در سیب زمینی، 46 ژنوتیپ از جمعیت f1 درحال تفرق دیپلوئید rh×sh با حداکثر نوترکیبی با استفاده از تکنیک nbs profiling در آزمایشگاه ژنومیکس دانشگاه واگنینگن هلند مورد ارزیابی قرار گرفتند. با استفاده از پنج آغازگر دژنره طراحی شده براساس موتیف های حفاظت شده دامنه nbs، در مجموع 187 نشانگر چندشکل تولید شد که در ارتباط با نقشه aflp جمعیت متشکل از 10000 نشانگر مکان یابی شدند. پس از توالی یابی تعدادی از نشانگرها و همردیف کردن آنها، 68 نشانگر با ژن های مقاومت شناخته شده یا پروتئین های مقاومت به بیماری گروه tir-nbs-lrr همولوژی نشان دادند. هفت تا از این rgaها جایگاه ژنی و توالی مشابه با ژن های مقاومت شناسایی شده در سیب زمینی یا گوجه-فرنگی داشتند. سی و هفت rga توالی یابی شده در نواحی کروموزومی مشابه با ژن های مقاومت شناسایی شده یا rgaها در گوجه-فرنگی یا سیب زمینی مکان یابی شدند بدون اینکه با این ژن های مقاومت یا rgaها از نظر توالی دارای همولوژی باشند و بقیه rgaها نیز در جایگاه هایی مکان یابی شدند که تاکنون در آنها rga گزارش نشده است. اکثر این rga ها در خوشه ها یا زیرخوشه-های جدید یا موجود در نقشه قرار گرفتند. در بررسی رابطه فیلوژنی، توالی های rga براساس آغازگر دژنره مورداستفاده برای تکثیر تفکیک شدند. نتایج حاصل از این پژوهش می تواند در مکان یابی ژن های مقاومت منفرد و مکان های کمی مقاومت به بیماری ها مورداستفاده قرار گیرد.
منابع مشابه
شناسایی آنالوگ‌های ژنهای مقاومت به بیماری (RGAs) در جمعیت F1 درحال تفرق سیب‌زمینی با استفاده از تکنیک NBS profiling
به‌منظور شناسایی و جداسازی آنالوگ‌های ژنهای مقاومت (RGAs) در سیب‌زمینی، 46 ژنوتیپ از جمعیت F1 درحال تفرق دیپلوئید RH×SH با حداکثر نوترکیبی با استفاده از تکنیک NBS Profiling در آزمایشگاه ژنومیکس دانشگاه واگنینگن هلند مورد ارزیابی قرار گرفتند. با استفاده از پنج آغازگر دژنره طراحی‌شده براساس موتیف‌های حفاظت‌شده دامنه NBS، در مجموع 187 نشانگر چندشکل تولید شد که در ارتباط با نقشه AFLP جمعیت متشکل ...
متن کاملجداسازی آنالوگ های ژن های مقاومت به بیماری(rgas) در سیب زمینی با استفاده از روش
استفاده از ارقام مقاوم یکی از راه کارهای اصلی کاهش خسارت ناشی از تنش های زیستی در گیاهان است. لازمه تولید چنین ارقامی شناسایی، جداسازی و مکان یابی ژن های مقاومت به بیماری است. در این پژوهش، برای جداسازی آنالوگ های ژن های مقاومت به بیماری در سیب زمینی از روش motif directed profiling (mdp) استفاده شد. بدین منظور، هفت آغازگر دژنره طراحی شده براساس دامنه حفاظت شده tir ژن های مقاومت به بیماری گیاهی ...
متن کاملجداسازی آنالوگ‌های ژنهای مقاومت به بیماری(RGAs) در سیب‌زمینی با استفاده از روش
استفاده از ارقام مقاوم یکی از راه‌کارهای اصلی کاهش خسارت ناشی از تنش‌های زیستی در گیاهان است. لازمه تولید چنین ارقامی شناسایی، جداسازی و مکان‌یابی ژنهای مقاومت به بیماری است. در این پژوهش، برای جداسازی آنالوگ‌های ژنهای مقاومت به بیماری در سیب‌زمینی از روش Motif directed Profiling (MdP) استفاده شد. بدین منظور، هفت آغازگر دژنره طراحی شده براساس دامنه حفاظت‌شده TIR ژنهای مقاومت به بیماری گیاهی...
متن کاملجداسازی و توالی یابی آنالوگ های ژن های مقاومت به بیماری ها (rgas)در ارقام زراعی و خویشاوندان وحشی جو
تولید ارقام مقاوم به بیماری ها، یکی از روش های زیست محیطی برای تولید پایدار و کنترل بیماری های گیاهی است. لازمه این کار شناسایی ژن های مقاومت و انتقال آن به ژنوتیپ -های مطلوب می باشد. به منظور جداسازی و توالی یابی آنالوگ های ژن های مقاومت به بیماری در جو، از 11 ترکیب آغازگرهای دژنره در شش رقم زراعی دایتون رانی، ماکویی، آبیدر، قره آرپا، سهند1 و urb81-3 و سه گونه وحشی hordeum marinum، h. spontane...
15 صفحه اولجداسازی ژنهای مقاومت به بیماری زنگ برگی جو و تولید نشانگرهای مبتنی بر pcr با استفاده از روش nbs profiling
زنگ برگی جو با عاملpuccinia hordei otth. یکی از مهم ترین بیماری های جو می باشد که سالانه باعث کاهش عملکرد قابل ملاحظه ای در محصول جو می شود. استفاده از ژنوتیپ های مقاوم یکی از موثرترین و اقتصادی ترین روش ها برای کنترل بیماری می باشد. تاکنون روش های متفاوتی از قبیل غربالگری در مزرعه و گلخانه، انتخاب به کمک نشانگرها و روش های مولکولی دیگری مانند آنالیز rgaها، جهت شناسایی منابع جدید مقاومت به زنگ ...
15 صفحه اولشناسایی تنوع ارقام گندم سیستان از لحاظ ژن های مقاومت به عوامل بیماری های زنگ گندم با نشانگر ریز ماهواره
در این پژوهش جهت بررسی تنوع ژنتیکی ارقام رایج گندم سیستان برای مقاومت به بیماری زنگ از 10 جفت آغازگر ریزماهواره‌ای پیوسته به ژنهای مقاومت به بیماری زنگ‌های زرد، قهوه‌ای و سیاه استفاده شد. آغازگرهای 12C، SCS719 و Xgdm116 با 3 آلل کمترین و آغازگر Xgwm443 با 7 آلل، بیشترین آلل را داشتند. میانگین تعداد آلل در کل جایگاه‌ها برابر 55/4 بود. بیشترین شاخص چندشکلی (39/0) و شاخص نشانگری (29/2) به ترتیب ...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
عنوان ژورنال:
علوم زراعی ایرانجلد ۱۲، شماره ۲، صفحات ۱۸۵-۱۹۸
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023